Dallo scorso 7 luglio è operativo il collegamento intermodale Padova -Interporto Lubjana di Interporto Padova Spa. La relazione è trisettimanale, il martedì, il giovedì e il sabato e la partenza del convoglio da Padova è fissata alle ore 5,08 del mattino. La chiusura del convoglio al terminal è fissata alle ore 19,30 del giorno precedente. Il collegamento con la capitale slovena è il secondo servizio attivato da Interporto Padova Spa come MTO, entro l'autunno diventeranno operative altre due relazioni con Venezia e Verona.
Infrastrutture
Le infrastrutture
Nell'area interportuale vi sono circa 350.000 mq di infrastrutture terminalistiche: l'accesso al Terminal Container, che attraverso tre gate permette la razionalizzazione dei traffici di ingresso e uscita, il Terminal Container di proprietà del Gruppo Fs, il Nuovo Grande Terminal di proprietà di Interporto Padova Spa, la cui superficie complessiva, con l'ampliamento dell'ottobre 2010 è di circa 220 mila mq. E' dotato di due fasci ciascuno formato da tre binari e di un ulteriore fascio di due binari, ognuno con uno sviluppo rettilineo di 750 metri. La limitrofa stazione merci Fs di Padova Interporto è funzionale a queste due strutture, grazie ai 21 binari di presa e consegna dei treni completi.Le attrezzature per la movimentazione e i servizi
Padova Container Service dispone di ben 15 macchine operatrici, 8 per i container vuoti e 7 per quelli pieni per la movimentazione di tutti i tipi di unità di carico container casse mobili e semirimorchi , per le operazioni di carico e scarico dagli autocarri e per la formazione dei treni.Nel piazzale del Nuovo Grande Terminal sorge anche l'officina per la riparazione e la manutenzione dei contenitori e sono disponibili le attrezzature per il loro lavaggio ordinario e fisico-chimico.

